本期高等教育深耕計畫，國立臺灣大學以日本京都大學為五年內短中程競逐目標、美國加州大學洛杉磯分校（UCLA）為未來長程標竿學校。透過校務研究分析梳理與京都大學之差異，從而訂定博士人才培育、研究能量永續與突破、基礎研究設施強化、國際研究連結等標竿競逐策略，具體執行。
博士人才培育：
為解決少子化現象所帶來博士生下降的衝擊，104學年起推動「逕行修讀博士學位學生研究提升計畫」，吸引優秀學生直攻博士學位。107年起擴大執行，補助名額增加至100名，近年幾乎都是滿額，目前全校共錄取567名逕博學生。
研究能量永續與突破
補助推動團隊型「核心研究群計畫」，由資深教師帶領年輕教師，共同推動新穎性研究課題，傳承研究能量。另推動45歲中生代個人型「深耕計畫」、「桂冠計畫」、「拾玉計畫」，分別鼓勵研究具新穎研究議題、研究表現傑出之年輕教師、及研究動能面臨短期困境的教師。107年推動至今，已組成89個各領域之核心群團隊計畫及累計挹注百件以上個人型計畫。此外，也特別重視人社領域之平衡發展，各項計畫皆給予特別支持。學術論文表現方面，本校論文引用於2021年達100萬次，較2020年成長3%；近十年高被引論文達762篇，已逐步追上京都大學；另本校共計15名高被引學者。相關研究策略推動已達成具體成效。
基礎研究設施強化
成立由質譜學、分子影像學、電子顯微學、半導體製程學及整合型生醫等高門檻研究技術構成之「國立臺灣大學重點技術平台」。由專業教授群、技術專家搭配尖端核心設施，組成專家系統，建構橫跨基礎分析服務與進階問題解決的專業平台，以新興技術發展、進階技術訓練、多元研究服務三大軸向，提供關鍵研究服務，推行至今成效卓著，成果發表於PNAS、Nat. Mater. 等期刊，電子顯微學重點技術平台於2020年新購置冷凍電子顯微鏡，預計於2022年底完成空間建置，並於2023年正式啟用，預計將更加提升生命科學、基礎醫學及新藥研發之研究能量。
策略重點姊妹校旗艦計畫與國際生入學機制改善
在研究上，本校擴大重點姊妹校計畫，透過媒合與種子合作補助計畫，鼓勵教師建立國際研究與教學合作，五年來與重點姊妹校合作之人數及合作發表論文數皆有顯著成長。在人才延攬上，本校自108年起重整境外招生團隊，整合校內各項境外生招生管道，並擴大宣傳、重新設計獎學金制度，五年來申請人數倍增；同時，建立第一個師徒制境外生實習計畫、第二導師計畫、學輔制度等，提供來校境外生更完善的照顧與輔導，能更無後顧之憂在本校學習及研究。